如今市場上的座便器的沖水方式原理基本是直沖式和虹吸式兩種大類。虹吸式中又分旋渦式虹吸和噴射式虹吸。虹吸式馬桶內有一個完整的管道，形狀呈側倒狀的 “S”，池壁坡度較緩，噪音問題有所改善;具有排污能力強，選凈面大的特點，所以絕大多數馬桶尤其是連體均采用虹吸式。最大優點就是沖水噪音小，也就是所謂的靜音。容易沖掉黏附在馬桶表面的臟物。缺點是：池底存水面積增大。
現在市場上的座便器的沖水原理基本是直沖式和虹吸式兩種大類。虹吸式中又分旋渦式虹吸和噴射式虹吸。
1、直沖式
直沖式座便器是利用水流的沖力來排出便便，一般池壁較陡，存水面積較小，這樣水力集中，便圈周圍的落下的水力加大，沖污效率高。
優點：直沖式座便器沖水管路簡單，路徑短，管徑粗(一般直徑在9至10厘米)，利用水的重力加速度就可以把便便沖干凈，沖水的過程短，與虹吸式相比從沖污能力上來說，直沖式座便器沒有返水彎采取直沖，容易沖下較大的污物，在沖刷過程中不容易造成堵塞，衛生間里不用備置紙簍。從節水方面來說，也比虹吸式座便器好。
缺點：直沖式座便器最大的缺陷就是沖水聲大，還有由于存水面較小，易出現結垢現象，防臭功也能不如虹吸式座便器，另外，直沖式座便器目前在市場上品種比較少，選擇面不如虹吸式座便器大。
2、虹吸式
虹吸式座便器的結構是排水管道呈“倒S”型，在排水管道充滿水后會產生一定的水位差，借沖洗水在便器內的排污管內產生的吸力將便便排走，由于虹吸式座便器沖排是不是借助水流沖力，所以池內存水面較大，沖水噪音較小。虹吸式座便器還分為旋渦式虹吸、噴射式虹吸兩種。
3、旋渦式虹吸
這種座便器沖水口設于座便器底部的一側，沖水時水流沿池壁形成旋渦，這樣會加大水流對池壁的沖洗力度，也加大了虹吸作用的吸力，更利于將馬桶內臟東西排出。
4、噴射式虹吸
在虹吸式座便器上做了進一步改進，在馬桶內底部增加一個噴射副道，對準排污口的中心，沖水時，水一部分從便圈周圍的布水孔流出，一部分由噴射口噴出，這種座便器是在虹吸的基礎上借助較大的水流沖力，將污物快速沖走。
優點：虹吸式座便器的最大優點就是沖水噪音小，稱之為靜音。從沖污能力上來說，虹吸式容易沖掉黏附在馬桶表面的污物，因為虹吸的存水較高，防臭效果優于直沖式，現在市場上虹吸式座便器品種繁多，買座便器會有更多的選余地。
缺點：虹吸式座便器沖水時先要放水至很高的水面，然后才將污物沖下去，所以要具備一定水量才可達到沖凈的目的，每次至少要用8升至9升水，相對來說比較費水。虹吸式的排水管徑也就56公分左右，沖水時容易堵塞，所以手紙不能直接扔在馬桶里中，安裝虹吸式座便器一般還要配備紙簍和搋子。
